《仙剑奇侠传三》故事发生在《仙剑》第一代的五十年前，那时候，李三思刚刚发出赤子的第一声啼哭;巫后还是襁褓中的婴儿，而剑圣，则还没有拜入蜀山修仙。
事情的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌，封印被解除开始的，但是，更深层的因果却要追溯到千年前的神界。
神界
神将军飞蓬与魔尊重楼因两界的冲突而屡屡交手，一直难分胜负，两人逐渐有惺惺相惜之意。
重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗，一较高下，飞蓬碍于神界天规而犹豫再三，最终经不起重楼诱惑而答允。
两人势均力敌，比试旷日持久，最终惊动了天庭，天帝派兵捉拿飞蓬问罪，飞蓬因感知到追兵将至而分心，佩剑被重楼打落人间而落败。
光阴荏苒，飞蓬被神界问罪贬为人，经过多次转世成为渝州唐门永安当铺伙计景天。
景天得到魔剑的同时，结识了唐门小姐雪见，从此改变了自己的生活。
一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中，而后遇到蜀山弃徒长卿及其未婚妻紫萱，景天走上了协助蜀山寻找五灵珠，封印锁妖塔的漫漫征途。
一直隐藏在魔剑中的鬼魂化身而出，竟然是景天前世龙阳的妹妹龙葵。
几个人的情爱纠葛，生离死别反复交织纠缠，雪见的离奇身世，紫萱不为人知的秘密，龙葵长久以来的心中愿望。伴随着人类与妖界死生存亡的争斗，而其实人的欲望，才是所有纷争的本源。
操作指南
1.连点鼠标左键，看到景天开始跑了，然后就按住左键，就可以了（或者连续→→ 或者←← 也行）
2.旋转鼠标滑轮可调整视觉角度（房屋内无效）
3.调整好方向后，有跳跃的地方，只要把鼠标指向对应位置后，点击右键即可跳跃
4.调换位置，进入整理选项，队列（阵型）点人物头像切换
5.点击左下角的指南针能显示小地图（必须用到的）
具体说明
左键双击：跑步（按住不放可持续跑步）
滚轮：转换视觉
右键：跳跃（在迷宫特定地点方可，头上出现弯曲的箭头）、取消
F8：截图 存放在snap目录下
空格键：对话、调查、确定、对话框翻页、结束消息框、界面中是否的选择条件下选是
Esc键：取消、返回上一级界面、界面中是否的选择条件下选否
回车键：打开系统界面、切换系统界面分页
TAB：切换人物、分页切换A：顺时针镜头转换
游戏中按“~”键可以令控制台出现/消失。
